东莞公司年报的申报流程如下：
申报时间：
企业、个体工商户、农民合作社的申报时间为每年的1月1日至6月30日。
外国（地区）企业常驻代表机构的申报时间为每年的3月1日至6月30日。
网上申报流程：
登录系统：使用IE8及以上版本浏览器登录国家企业信用信息公示系统（广东），网址为 。
进入年度报告填报：在首页点击“企业信息填报”或“年度报告及信息公示”。
填写年报：选择要报送的年报年度，按提示填写相关内容，包括基本信息、股东及出资信息、对外投资信息、资产状况信息等。
预览并提交：完成填写后，点击“预览并公示”，检查所填写的所有信息无误后，点击“提交并公示”，待出现“提交成功”的弹出窗口，点击确认，即完成年报申报。
其他申报方式：
除了网上申报，还可以通过粤商通app、东莞市场监管公众号、纸质报送等方式进行申报。
注意事项：
确保在规定的时间内完成申报，否则将被列入经营异常名录，影响公司的正常运营。
在填报前，请行“企业联络员注册”，若注册信息发生变化请进行“企业联络员变更”。
通过以上步骤，东莞公司可以顺利完成年报的网上申报。