引入问题
在过去的几年里,新冠疫情对全球的影响是深远的,疫情的发展和变异株的出现让许多人感到焦虑。虽然有疫苗和疗法的出现,但我们依然无法完全掌控这一病毒的变异过程。你是否曾想过,在这些新变异株之间,究竟是何种原因影响了它们对宿主的选择?新冠病毒是否正在朝着更具传染性或致病性的方向进化?根据数据显示,全球新冠感染病例已逾6亿,疫情的变化带来了许多不确定性。每一种新变异株的出现,都意味着对公共健康的潜在威胁和更高的传播风险。对此,提高对新冠病毒变异株的认识,尤其是如何影响宿主嗜性是非常必要的。
科普知识
近日,解放军疾病预防控制中心宋宏彬研究员及其团队与中国医学科学院、军事科学院等研究机构合作,开展了一项重要研究,使用深度学习方法来分析新冠变异株的宿主嗜性。这项研究建立了基于语言嵌入的注意力递归网络模型(ARNLE),能够量化评估新冠病毒的宿主转变和传播能力。研究表明,新冠病毒在流行过程中不断转向人类宿主,传染性逐渐增强而致病性相对减弱,因此与宿主达成了一种“共生”状态。
为了更清晰地理解这一过程,研究人员提取了2019年12月前病毒来源于的六大宿主类别中的五种主要编码蛋白的氨基酸序列。通过ELMo语言模型和双向长短期记忆网络(Bi-LSTM)模型的整合,研究者不仅成功对宿主进行分类识别,还发现早期变异株对人类宿主嗜性维持较低,随着时间推移,尤其是Alpha变异株出现后,对人类宿主的嗜性迅速上升。
这项研究结合贝叶斯方法,识别了影响病毒宿主嗜性的关键变异位点,例如T478K、L452R、N501Y和P681H/R更是被确认对病毒感染的宿主细胞或免疫逃避能力具有正面影响。综上所述,这为我们理解病毒从早期学会适应人类宿主的变迁提供了科学依据,强调了在病毒流行初期进行有效干预的重要性。
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总结和号召