南京市雨花医院始建于1956年，是雨花台区唯一一所政府办区属非营利性二级综合性医院，是江苏省和南京市医保定点单位、雨花台区新农合定点医疗机构、省（市）级公费医疗定点单位。
医院占地面积13485平方米，建筑面积22548平方米，设有床位170张，设有中心吸引、中心供氧、中央空调等系统。科室设有急诊医学科、内科（心血管科、呼吸科、消化科、内分泌科、肿瘤科、神经内科、肾脏科、疼痛科）、外科（骨科、普外科、乳腺外科、肛肠科）、康复医学科、妇产科、儿科、口腔科、眼科、耳鼻喉科、皮肤科、中医科、针灸科、推拿科、感染科、医学影像科、医学检验科、功能检查科（B超室、心电图室、心功能检查室）、麻醉手术科、层流净化手术室、血液透析中心、消化内镜中心、体检中心、消毒供应中心、西药房、中草药房等。拥有全自动生化分析仪、64排128层CT、数字化X线摄影系统（DR）、口腔全景CT、高频移动式（C臂）X射线机、高清电子胃肠镜、高清电子腹腔镜、高清关节镜、电子阴道镜、进口彩色多普勒B超、24小时动态心电图、肛肠微波治疗仪、心电监护等先进医疗设备。
医院已与南京市第一医院、南京市胸科医院等多家“三甲”医院建立了医疗联合体，定期将有三级医院的专家坐诊、查房，可为周边地区的社区居民提供便捷、高效、优质的医疗卫生保健服务。
特色科室有：骨科、肛肠科、消化科、心血管科、呼吸科、神经内科、血液透析中心、消化内镜中心、健康体检中心、中医馆、区域医学影像诊断中心、区域临床检验中心、区域远程区域消毒供应中心等。