大型仪器
2025-01-03 02:23
系统与进化植物学国家重点实验室现有3个研究平台：结构植物学与显微成像平台、基因测序与生物信息学平台和分子生物学平台三个平台，共有大型设备40台（套），总价值3200余万元。
(一)结构植物学与显微成像平台
植物形态与结构观察检测平台拥有和完善多尺度、多层次不同植物组织器官结构的表征观察与形态记录手段，建成在超微结构、亚细胞、细胞、组织、器官和个体等一系列水平上的观察、分析和研究平台。通过购置大型先进仪器及重要附件功能的改进，提高仪器的综合性能，发展新的实验手段，具备完成植物（含植物化石）各级结构观察研究工作的能力。
1.高分辨率扫描电子显微镜
放置地点：进化实验室C115电镜室
仪器管理员: 徐秀苹 62836089 邮箱：xpxu@ibcas.ac.cn
英文名称：Hitachi S-4800 Field Emission Scanning Electron Microscope
型号及生产厂家： S-4800，日本日立
设备简介：二次电子像分辨率：1.0 nm（15kv.WD=4mm），放大倍率：20-800.000x （高低倍转换），样品台：五轴马达驱动；
区域中心内（元） | 区域中心外（元） | | 超高分辨率扫描电子显微镜(日立S—4800) | 320元/小时 | 400元/小时 |
| 离子溅射镀膜（日立E1010） | 50元/样品台 | 50元/样品台 |
| 临界点干燥仪（日立HCP-2） | 200元/次 | 200元/次 |
2.高内涵细胞成像系统
放置地点：进化小院高内涵细胞成像室
仪器管理员: 徐秀苹 62836089 邮箱：xpxu@ibcas.ac.cn
英文名称：HCS, High Content System
型号及生产厂家： PE Operetta 英国珀金埃尔默
3.流式细胞仪
放置地点：进化实验室D204流式细胞仪室
仪器管理员:徐秀苹 62836089 邮箱：xpxu@ibcas.ac.cn
英文名称：BD LSRFortessaTM cell analyzer
型号及生产厂家： BD LSRFortessa 美国BD
4.显微CT扫描系统
放置地点：进化实验室古植物馆二层 仪器管理员: 徐秀苹 62836089 邮箱：xpxu@ibcas.ac.cn
英文名称：Micro-CT scanner
型号及生产厂家：Bruker SkyScan1172比利时Bruker
放置地点：进化实验室D203室
仪器管理员: 徐秀苹 62836089 邮箱：xpxu@ibcas.ac.cn
英文名称：laser microdissection system
型号及生产厂家：Leica LMD7000德国徕卡
6.正置荧光显微镜
放置地点：进化实验室C103结构植物学室
仪器管理员: 温洁 62836437 邮箱：jwen@ibcas.ac.cn
英文名称：Zeiss Axio Imager 1 Upright light microscope
型号及生产厂家：Zeiss Image A1德国蔡司
| 分析项目 | 区域中心内（元） | 区域中心外（元） |
| 荧光照相 | 50元/小时 | 60元/小时 |
| 明场照相 | 30元/小时 | 40元/小时 |
放置地点：进化实验室C103结构植物学室、标本馆、古植物馆和进化小院
仪器管理员: 温洁 蔡清 62836437 62836743 邮箱：caiqing@ibcas.ac.cn , jwen@ibcas.ac.cn
英文名称：Leica DMRBE Light Microscope
型号及生产厂家：Leica DM5000B、Leica DM4000B、Leica M165FC 德国徕卡 尼康SMZ1000 日本尼康
| 分析项目 | 区域中心内（元） | 区域中心外（元） |
| 明场体视镜（LeicaS8APO尼康SMZ1000）和明场显微镜 Leica DM4000B） | 30元/小时 | 40元/小时 |
| 荧光显微镜成像（Leica DM5000B） | 50元/小时 | 60元/小时 |
| 荧光体视镜（Leica M165FC） | 50元/小时 | 60元/小时 |
（二）基因测序与生物信息学平台
生物信息大分子DNA片段分析平台。利用全新DNA测序技术及相关基因与基因组海量数据分析理论和方法，重点研究植物若干大类群的形成和演化，构建植物生命之树，重现和阐明植物进化过程中的重要事件、历程和格局。将基因和基因组测序的前沿技术分析手段应用于相关基础理论研究，解决系统与进化生物学领域中重大科学问题。同时，利用高性能计算平台提供的设备保障和环境支持，升级和扩展现有并行计算集群系统，扩充本地计算和存储能力，应对今后不断增长的生物信息学计算需求。加强解决分子系统学和分子进化、植物比较基因组和基因组进化、群体与数量遗传学、大规模表达数据以及新一代高通量测序数据的处理等多个领域研究工作所需的分析和存储能力。
放置地点：进化实验室C217测序室
仪器管理员: 孙艺珍 靳婉青 62836494 邮箱：yzsun@ibcas.ac.cn, sequencejin@ibcas.ac.cn
英文名称：HiSeq 2500 DNA sequencing system
型号及生产厂家：llumina HiSeq2500、Illumina cBot 美国Illumina
| 分析项目 | 区域中心内（元） | 区域中心外（元） |
| DNA library | 380元/样品 | 494元/样品 |
| RNA Direc library | 520元/样品 | 676元/样品 |
| Illumina HiSeq2500（Rapid run（PE100）） | 28000元/FC(2 lane/FC)或700元/Gb | 36400元/FC(2 lane/FC)或910元/Gb |
| Illumina HiSeq2500 (Rapid run（PE150）） | 42000元/FC(2 lane/FC)或800元/Gb | 54600元/FC(2 lane/FC)或1040元/Gb |
| High output run（PE100） | 15000元/FC(8 lane/FC)或600元/Gb | 19500元/FC(8 lane/FC)或780元/Gb |
2.基因测序仪 放置地点：进化实验室C217测序室
仪器管理员: 孙艺珍 靳婉青 62836494 邮箱：yzsun@ibcas.ac.cn，sequencejin@ibcas.ac.cn
英文名称：3730XL DNA Analyzer
型号及生产厂家： AB 3730XL美国AB
放置地点：进化实验室C216测序室
仪器管理员: 孙艺珍 靳婉青 62836494 邮箱：yzsun@ibcas.ac.cn, sequencejin@ibcas.ac.cn
英文名称：Ion Proton System
型号及生产厂家： LT Ion Proton & LT Ion OneTouch美国life technologies
| 分析项目 | 区域中心内（元） | 区域中心外（元） |
| DNA library | 360元/样品 | 468元/样品 |
| RNA Direc library | 600元/样品 | 780元/样品； |
| LT Ion Proton | 7800元/Run或1000元/Gb | 10140元/run或1300/ Gb |
放置地点：进化实验室C217测序室
仪器管理员: 孙艺珍 靳婉青 62836494 邮箱：yzsun@ibcas.ac.cn, sequencejin@ibcas.ac.cn
英文名称：Library preparation related devices
型号及生产厂家：Covaris M220、Agilent 2100、JENA Tower2.2 QPCR和LT Qubit
| 分析项目 | 区域中心内（元） | 区域中心外（元） |
| Covaris M220 | 60元/样品 | 78元/样品 |
| Agilent 2100 | 20元/样品 | 26元/样品 |
| JENA Tower2.2 QPCR | 60元/样品 | 78元/样品 |
| LT Qubit | 12元/样品 | 16元/样品 |
5.浪潮计算集群
放置地点：D101大型机室
仪器管理员: 李哲 62836150 邮箱：lizhe@ibcas.ac.cn
英文名称：Computer cluster
型号及生产厂家：浪潮天梭TS10K 中国浪潮
区域中心内（元） | 区域中心外（元） | | 双路计算节点： | 0.05元/核心*小时；配置：双路八核：单节点共计16核心；CPU型号：Intel? Xeon? CPU E5-2670 ，主频 2.60GHz；标配内存：128GB/节点 | 同区域中心内 |
| 胖节点 | 0.05元/核心*小时；配置：四路八核：单节点共计32核心；CPU型号：Intel? Xeon? CPU E7-4820 ，主频 2.00GHz；标配内存：512GB/节点 | 同区域中心内 |
| 存储系统HASH卷 | 0.2元/GB*月；高性能集群并行文件系统，高读写性能，仅提供基于RAID的冗余 | 同区域中心内 |
| 存储系统复制卷 | 0.4元/GB*；高性能集群并行文件系统，同时提供基于RAID的冗余及基于文件系的复制冗余策略 | 同区域中心内 |
收费标准：每用户提供100GB初始免费HASH卷存储空间。
(三) 分子生物学研究平台
生物大分子DNA、RNA和蛋白质序列变异、结构和功能分析平台。通过完善检测技术和分析生物大分子在不同时空格局中表达式样的研究能力，重点研究一些特殊表达基因与蛋白质的调控机理、结构形成和功能演化，阐明其结构与功能的演化历史，探讨基因与蛋白质结构与功能进化与植物多样性的进化发育机理等科学问题。
放置地点：进化小院
仪器管理员：蔡清 62836743 邮箱：caiqing@ibcas.ac.cn
英文名称：Biomolecular Interaction Analyzer
型号及生产厂家：GE Biacore 3000 美国GE
放置地点：进化小院
仪器管理员：张晋丹 62836089 邮箱：jdzhang01@ibcas.ac.cn
英文名称：Agilent 5975C series GC/MSD
型号及生产厂家：Agilent 7890 GC/ 5975c MS detector 美国Agilent
放置地点：进化小院公共实验室
仪器管理员：蔡清 62836743 邮箱：caiqing@ibcas.ac.cn
英文名称：Auto magnetic particle extraction and purification system
型号及生产厂家：Thermo KingFisher Flex 美国Thermo KingFisher
放置地点：D203室
仪器管理员：张晋丹 62836089 邮箱：jdzhang01@ibcas.ac.cn
英文名称：Capillary Electrophoresis Analysis System
型号及生产厂家：Beckman Proteome Lab PA800 plus 美国Beckman/AB SCIEX
放置地点：C112室
仪器管理员：张晋丹 62836089 邮箱：jdzhang01@ibcas.ac.cn
英文名称：Optima L-100XP Ultracentrifuge
型号及生产厂家：Beckman Optima L-100XP美国Beckman
放置地点：C203室
仪器管理员：张晋丹 62836089 邮箱：jdzhang01@ibcas.ac.cn
英文名称：Laboratory Automation Workstation
型号及生产厂家：Beckman Biomek3000美国Beckman
7. 双向电泳系统（含成像系统）
放置地点：C116室
仪器管理员：张晋丹 62836089 邮箱：jdzhang01@ibcas.ac.cn
英文名称：Two-Dimensional Electrophoresis System (including Molecular Imager system)
型号及生产厂家：BIO-RAD IEF、MP4、ProteanⅡXL、PROTEAN Plus Dodeca Cell、PROTEAN Plus Dodeca Cell、Molecular Imager PharosFX Plus System美国Bio-Rad
8. 蛋白质纯化系统
放置地点：C116室
仪器管理员：张晋丹 62836089 邮箱：jdzhang01@ibcas.ac.cn
英文名称：Protein purification system
型号及生产厂家：BIO-RAD BioLogic DuoFlow Pathfinder 20 System 美国Bio-Rad
9. 荧光分光光度计
放置地点：C110室
仪器管理员：张晋丹 62836089 邮箱：jdzhang01@ibcas.ac.cn
英文名称：Fluorescence analyzer
型号及生产厂家：Hitachi F7000日本Hitachi
10.多功能酶标仪
放置地点：C110室
仪器管理员：张晋丹 62836089 邮箱：jdzhang01@ibcas.ac.cn
英文名称：Multifunctional micro-plate reader
型号及生产厂家：Beckman DTX-880美国Beckman/MD
11. 荧光定量PCR仪
放置地点：C110室、进化实验室、C202室、C217室
仪器管理员：张晋丹 蔡清 孙艺珍 62836089 62836743 62836494
邮箱：jdzhang01@ibcas.ac.cn, caiqing@ibcas.ac.cn, yzsun@ibcas.ac.cn
英文名称：QPCR System
型号及生产厂家： AB ViiA7、AB StepOne plus、Roche LC96、JENA qTower2.2美国AB、瑞士罗氏、德国耶拿
放置地点：C111室、进化西区实验室、C203室、C208室
仪器管理员：张晋丹 蔡清 62836089 62836743 邮箱：jdzhang01@ibcas.ac.cn, caiqing@ibcas.ac.cn
英文名称：High speed refrigerated centrifuge
型号及生产厂家：Beckman J26S-XPI、J30I等美国Beckman
